Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccm2lQ8VCC6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccm2lQ8VCC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms