Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MpdzQ8VBX6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MpdzQ8VBX6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms