Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms