Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc58Q8R3Q6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms