Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg10Q8R1P4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms