Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms