Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rdh16f2Q8K3M1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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