Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms