Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nsl1Q8K305 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms