Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms