Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms