Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms