Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms