Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sde2Q8K1J5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms