Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms