Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scnm1Q8K136 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scnm1Q8K136 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scnm1Q8K136 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms