Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbrd1Q8K0B2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms