Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l2Q8JZQ2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms