Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Znf628Q8CJ78 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms