Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SbsnQ8CIT9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbsnQ8CIT9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbsnQ8CIT9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms