Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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