Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip3Q8CHD8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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