Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc43a2Q8CGA3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc43a2Q8CGA3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms