Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setd1bQ8CFT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Setd1bQ8CFT2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms