Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a2Q8CFE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a2Q8CFE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a2Q8CFE6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms