Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Hpf1Q8CFE2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Hpf1Q8CFE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Hpf1Q8CFE2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Hpf1Q8CFE2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hpf1Q8CFE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms