Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ercc8Q8CFD5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ercc8Q8CFD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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