Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp27Q8CEG8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp27Q8CEG8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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