Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc17Q8CE13 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc17Q8CE13 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms