Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc63Q8CDV6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc63Q8CDV6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms