Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph6aQ8CDR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph6aQ8CDR2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms