Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SynpoQ8CC35 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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