Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacnb2Q8CC27 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacnb2Q8CC27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms