Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrip1Q8CBD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms