Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slfn5Q8CBA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms