Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhe22Q8C6A8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms