Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8C5C9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8C5C9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms