Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rae1Q8C570 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rae1Q8C570 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms