Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Amigo3Q8C2S7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Amigo3Q8C2S7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo3Q8C2S7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo3Q8C2S7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo3Q8C2S7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo3Q8C2S7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Amigo3Q8C2S7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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