Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec22cQ8BXT9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec22cQ8BXT9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms