Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube3dQ8BX13 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ube3dQ8BX13 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ube3dQ8BX13 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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