Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp5Q8BX09 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp5Q8BX09 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms