Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp38Q8BW70 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp38Q8BW70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp38Q8BW70 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Usp38Q8BW70 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Usp38Q8BW70 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Usp38Q8BW70 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp38Q8BW70 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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