Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep55Q8BT07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep55Q8BT07 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms