Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prpf18Q8BM39 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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