Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hirip3Q8BLH7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms