Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp54Q8BL06 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp54Q8BL06 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms