Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zcchc4Q8BKW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms