Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem87bQ8BKU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem87bQ8BKU8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms