Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan12Q8BKT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan12Q8BKT6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms