Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D130040H23RikQ8BII3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
D130040H23RikQ8BII3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms